食品微生物实验室的实验对象是致病微生物，所以操作过程中产生的废液、废气和废物中不可避免的带有致病微生物。因此为了保证实验室的生物安全，必须及时的对实验过程中产生的废液、废气和废物进行处理。防止其感染实验人员和污染实验室及周围的环境。
实验室废弃物的处理和处置的管理应符合国家或地方法规和标准的要求，应征询相关主管部门的意见和建议。在设计和执行关于生物危害性废弃物处理、运输和废弃的规划之前，必须参考最新版的相关文件。实验室废弃物的管理目的是将操作、收集、运输、处理及处置废弃物的危险减至为零，将其对环境的危害降为零。实验室废弃物处理只可使用被承认的技术和方法，废弃物的排放应符合国家或地方规定和标准的要求。一般情况下，高压灭菌过的废弃物可以在指定垃圾场掩埋处理，或在其他地方焚烧后处理。焚烧炉内的灰烬可以作为普通家庭废弃物处理并由地方有关部门运走。
应根据危险废物的性质和危险性按相关标准分类处理和处置废物；危险废物应弃置于专门设计的、专用的和有标识的用于处置危险废物的容器内，装量不能超过建议的装载容器；锐器(包括针头、小刀、金属和玻璃等)应直接弃置于耐扎的容器内；应由经过培训的人员处理危险废物，并应穿戴适当的个体防护装备；不应积存垃圾和实验室废物；在消毒灭菌被或最终处置之前，应存放在指定的安全地方；不应从实验室取走或排放不符合相关运输或排放要求的实验室废物；应在实验室内消毒灭菌含活性高致病生物因子的废物；如果法规许可，只要包装和运输方式符合危险废物的运输要求，可以运送未处理的危险废物到指定机构处理。
下面结合食品微生物实验室介绍实验室废弃物的处理。
01
废液的处理
食品微生物实验室废水来自有致病菌的培养物、洗涤水以及其他诊断检测样品等。对于实验室产生的废水，应尽快消毒灭菌，严防污染扩散，要加强污染源管理。
废液处理方法有化学药剂法和热力消毒灭菌法。根据不同的处理对象和处理要求采用不同的方法对废液进行处理。
(一)化学药剂法
化学消剂按其杀菌由强到弱可分为灭菌剂、消毒剂、抑菌剂。废水化学法消毒最好采用相关发生器、虹吸投药法或高位槽投药法，也可以在废水入口处直接投加。投放用加氯机，投放二氧化氯用二氧化氯发生器，投放次氯酸钠用发生器或液体药剂，投放臭氧用臭氧发生器，投放过氧化氢用过氧化氢发生器。
(二)物理热力法
生物安全实验室物理热力法废液处理系统是通过加热方式连续对废液进行消毒灭菌处理的，目的是使废液在尽可能短的时间内得到处理，避免引起污染扩散。
连续式废液消毒灭菌是一种对生物性废液进行灭菌的新技术，主要运用于生物安全实验室废液的处理。实验室产生的废液通过双层排水管道从废液入口进入缓冲储液罐，产生的废气经过高效过滤器除菌后从透气管排出。当液面达到一定的高度时，废液出口阀门自动打开，同时启动流速控制泵。将废液以设定流速压入预加热/冷却柜进行预加热处理，之后进入电加热灭菌器，在灭菌器内废液通过电加热灭菌盘管进行高温灭菌。已灭菌的废液再进入预加热/冷却柜经缓冲管后进行冷却，冷却后的废液通过排污口排出。如需如此处理，则通过回流管回流至储液罐，或直接进行再次连续处理。预加热/冷却柜通过热交换器，使已灭菌的高温废液对进入的待处理废液进行预加热，同时自己得到冷却，以节约能源。与传统的储罐式灭菌技术相比，连续废液消毒在效率、有效性、安全性和节约成本等方面都有了很大提高。
（三)混合处理法
对于生物安全实验室来说，其实验的对象种类较多，需要对废液进行不同的处理，适用于采用化学药剂和物理热力混合法处理系统。该系统将热力法连续废液灭菌系统与化学药剂处理装置结合，对废液进行热力灭菌处理和化学药剂处理，还可对灭菌系统内管道进行化学消毒。
(四)第二级废水处理系统
第二级废水处理系统可以处理经生物安全实验室内第一级废液处理系统处理后排出的废水,还可以处理来自食堂、洗澡池、卫生间、洗手盆的一般生活污水及普通实验过程中排放的无致病性微生物，但含有其他化学污染物的废水。第二级废水处理系统具备有效去除酸碱、重金属、有机溶剂及杀灭一般微生物的功能，使处理后的水质达到排放或中水回用的标准。
第二级废水处理系统的原理及工艺流程如下：来自生物安全实验室的废水经隔油器除油，同生活污水经由孔径为10mm的格栅除去较大的固体漂浮物后，汇集到调节池进行混合处理，再经直径2mm~5mm的格栅处理，除去直径大于5mm的固体漂浮物，进入初沉池。沉淀后上清液流入生化处理池进行生化处理，再经二次沉淀池沉淀后进入接触池进行最后处理，符合GB 8978 《国家污水综合排放标准》后排放。
02
废气的处理
食品微生物实验室的排风、仪器设备(生物安全柜、通风柜等)的排气会带有致病微生物，这种废气如果直接排放到实验室外，将会感染人群及动物，引起流行病暴发，严重威胁人类生命健康。因此，实验室产生的废气，经过严格消毒处理后方可排放。
